Python SciPy hierarchy.to_tree用法及代碼示例

本文簡要介紹 python 語言中 scipy.cluster.hierarchy.to_tree 的用法。

用法:

scipy.cluster.hierarchy.to_tree(Z, rd=False)#

將鏈接矩陣轉換為 easy-to-use 樹對象。

返回對根 ClusterNode 對象的引用(默認情況下)。

每個 ClusterNode 對象都有一個 left 、 right 、 dist 、 id 和 count 屬性。左右屬性指向組合起來生成簇的ClusterNode對象。如果兩者都是None，則 ClusterNode 對象是葉節點，其計數必須為1，其距離無意義但設置為0。

注：該函數是為了方便 Library 用戶而提供的。 ClusterNodes 不用作此庫中任何函數的輸入。

參數 ：：

Z： ndarray

正確形式的鏈接矩陣(參見 linkage 函數文檔)。

rd： 布爾型，可選

如果為 False(默認)，則返回對根 ClusterNode 對象的引用。否則，返回元組(r, d)。 r 是對根節點的引用，而 d 是 ClusterNode 對象的列表 - 鏈接矩陣中的每個原始條目加上所有聚類步驟的條目。如果一個cluster id小於鏈接矩陣說明的數據中的樣本數n，那麽它對應一個singleton cluster(葉子節點)。有關將集群 ID 分配給集群的更多信息，請參閱 linkage 。

返回 ：：

tree： ClusterNode 或元組(ClusterNode，ClusterNode 列表)

如果rd為假，aClusterNode.如果rd為 True，長度列表2*n - 1， 和n樣本數量。參見說明rd以上了解更多詳情。

例子：

>>> import numpy as np
>>> from scipy.cluster import hierarchy
>>> rng = np.random.default_rng()
>>> x = rng.random((5, 2))
>>> Z = hierarchy.linkage(x)
>>> hierarchy.to_tree(Z)
<scipy.cluster.hierarchy.ClusterNode object at ...
>>> rootnode, nodelist = hierarchy.to_tree(Z, rd=True)
>>> rootnode
<scipy.cluster.hierarchy.ClusterNode object at ...
>>> len(nodelist)
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