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Python Parameters.num_hydrogens方法代碼示例

本文整理匯總了Python中zeobuilder.actions.composed.Parameters.num_hydrogens方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Parameters.num_hydrogens方法的具體用法?Python Parameters.num_hydrogens怎麽用?Python Parameters.num_hydrogens使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在zeobuilder.actions.composed.Parameters的用法示例。


在下文中一共展示了Parameters.num_hydrogens方法的2個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: fn

# 需要導入模塊: from zeobuilder.actions.composed import Parameters [as 別名]
# 或者: from zeobuilder.actions.composed.Parameters import num_hydrogens [as 別名]
    def fn():
        context.application.model.file_open("test/input/tpa.xyz")
        Atom = context.application.plugins.get_node("Atom")
        for child in context.application.model.universe.children[::-1]:
            if isinstance(child, Atom) and child.number == 1:
                context.application.model.universe.children.remove(child)
        context.application.main.select_nodes([context.application.model.universe])
        AutoConnectPhysical = context.application.plugins.get_action("AutoConnectPhysical")
        assert AutoConnectPhysical.analyze_selection()
        AutoConnectPhysical()

        parameters = Parameters()
        parameters.num_hydrogens = 2
        parameters.valence_angle = 1.9093

        context.application.main.select_nodes([context.application.model.universe.children[1]])
        SaturateHydrogensManual = context.application.plugins.get_action("SaturateHydrogensManual")
        assert SaturateHydrogensManual.analyze_selection(parameters)
        SaturateHydrogensManual(parameters)
開發者ID:molmod,項目名稱:zeobuilder,代碼行數:21,代碼來源:test_molecular.py

示例2: default_parameters

# 需要導入模塊: from zeobuilder.actions.composed import Parameters [as 別名]
# 或者: from zeobuilder.actions.composed.Parameters import num_hydrogens [as 別名]
 def default_parameters(cls):
     result = Parameters()
     result.num_hydrogens = 2
     result.valence_angle = 109.4*deg
     return result
開發者ID:molmod,項目名稱:zeobuilder,代碼行數:7,代碼來源:molecule.py


注:本文中的zeobuilder.actions.composed.Parameters.num_hydrogens方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。