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Python TableIO.format_string方法代碼示例

本文整理匯總了Python中xplib.TableIO.format_string方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python TableIO.format_string方法的具體用法?Python TableIO.format_string怎麽用?Python TableIO.format_string使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在xplib.TableIO的用法示例。


在下文中一共展示了TableIO.format_string方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: Main

# 需要導入模塊: from xplib import TableIO [as 別名]
# 或者: from xplib.TableIO import format_string [as 別名]
def Main():
    '''
    IO TEMPLATE
    '''
    global args,out
    args=ParseArg()
    if args.output=="stdout":
        out=sys.stdout
    else:
        try:
            out=open(args.output,"w")
        except IOError:
            print >>sys.stderr,"can't open file ",args.output,"to write. Using stdout instead"
            out=sys.stdout
    if args.input=="stdin":
        fin=sys.stdin
    else:
        try:
            x=args.input.split(".")
            if x[-1]=="gz":
                fin=gzip.open(args.input,"r")
            else:
                fin=open(args.input,"r")
        except IOError:
            print >>sys.stderr,"can't read file",args.input
            fin=sys.stdin
    '''
    END OF IO TEMPLATE 
    '''
    print >>out,"# This data was generated by program ",sys.argv[0]," (version: %s)"%VERSION,
    print >>out,"in bam2x ( https://github.com/nimezhu/bam2x )"
    print >>out,"# Date: ",time.asctime()
    print >>out,"# The command line is :"
    print >>out,"#\t"," ".join(sys.argv)
    h1={}
    h2={}

    for i in TableIO.parse(fin):
        h1[i[args.c1-1]]=i
    for j in TableIO.parse(args.input2):
        h2[j[args.c2-1]]=j

        if h1.has_key(j[args.c2-1]):
            print >>out,TableIO.format_string(h1[j[args.c2-1]])+"\t"+TableIO.format_string(j)
開發者ID:purcaro,項目名稱:bam2x,代碼行數:46,代碼來源:xMergeTab.py


注:本文中的xplib.TableIO.format_string方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。