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Python NotePad.text_id方法代碼示例

本文整理匯總了Python中xbb_utils.NotePad.text_id方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python NotePad.text_id方法的具體用法?Python NotePad.text_id怎麽用?Python NotePad.text_id使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在xbb_utils.NotePad的用法示例。


在下文中一共展示了NotePad.text_id方法的5個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: export

# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
 def export(self):
     """Export selected text to new text window."""
     seq = self.get_selection_or_sequence()
     if not seq:
         return
     np = NotePad()
     tid = np.text_id()
     tid.insert('end', seq)
開發者ID:abradle,項目名稱:biopython,代碼行數:10,代碼來源:xbb_widget.py

示例2: gcframe

# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
 def gcframe(self, direction='both'):
     seq = self.get_selection_or_sequence()
     if not seq:
         return
     np = NotePad()
     tid = np.text_id()
     tid.insert('end',
                self.translator.gcframe(seq, self.current_codon_table_id,
                                        direction))
開發者ID:abradle,項目名稱:biopython,代碼行數:11,代碼來源:xbb_widget.py

示例3: extract

# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
 def extract(self):
     seq = self.get_selection_or_sequence()
     frame = self.frame_int.get()
     if not seq:
         return
     aa_seq = self.translator.frame(seq, frame, self.current_codon_table_id)
     aa_seq = re.sub('(.{50})', '\\1\n', str(aa_seq))
     np = NotePad()
     tid = np.text_id()
     tid.insert('end', '>frame%d\n%s' % (frame, aa_seq))
開發者ID:abradle,項目名稱:biopython,代碼行數:12,代碼來源:xbb_widget.py

示例4: translate

# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
 def translate(self):
     seq = self.get_selection_or_sequence()
     frame = self.frame_int.get()
     if not seq:
         return
     np = NotePad()
     tid = np.text_id()
     tid.insert('end',
                self.translator.frame_nice(seq, frame,
                                           self.current_codon_table_id))
開發者ID:abradle,項目名稱:biopython,代碼行數:12,代碼來源:xbb_widget.py

示例5: statistics

# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
    def statistics(self):
        seq = self.get_selection_or_sequence()
        if not seq:
            return
        seq = seq.upper()
        aa = {'A': 0, 'C': 0, 'G': 0, 'T': 0, 'N': 0}
        for nt in seq:
            if nt not in aa:
                nt = 'N'
            aa[nt] = aa[nt] + 1

        GC = (100.0 * (aa['G'] + aa['C'])) / len(seq)

        np = NotePad()
        tid = np.text_id()

        tid.insert('end', "%s\n\n" %
                   (time.strftime('%y %b %d, %X\n',
                                  time.localtime(time.time()))) +
                   "Length = %d\nA=%d C=%d G=%d T=%d other=%d\nGC=%f\n\n" %
                   (len(seq), aa['A'], aa['C'], aa['G'], aa['T'], aa['N'], GC))
開發者ID:abradle,項目名稱:biopython,代碼行數:23,代碼來源:xbb_widget.py


注:本文中的xbb_utils.NotePad.text_id方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。