本文整理匯總了Python中xbb_utils.NotePad.text_id方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python NotePad.text_id方法的具體用法?Python NotePad.text_id怎麽用?Python NotePad.text_id使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類xbb_utils.NotePad
的用法示例。
在下文中一共展示了NotePad.text_id方法的5個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: export
# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
def export(self):
"""Export selected text to new text window."""
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', seq)
示例2: gcframe
# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
def gcframe(self, direction='both'):
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end',
self.translator.gcframe(seq, self.current_codon_table_id,
direction))
示例3: extract
# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
def extract(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
frame = self.frame_int.get()
if not seq:
return
aa_seq = self.translator.frame(seq, frame, self.current_codon_table_id)
aa_seq = re.sub('(.{50})', '\\1\n', str(aa_seq))
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', '>frame%d\n%s' % (frame, aa_seq))
示例4: translate
# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
def translate(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
frame = self.frame_int.get()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end',
self.translator.frame_nice(seq, frame,
self.current_codon_table_id))
示例5: statistics
# 需要導入模塊: from xbb_utils import NotePad [as 別名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 別名]
def statistics(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
seq = seq.upper()
aa = {'A': 0, 'C': 0, 'G': 0, 'T': 0, 'N': 0}
for nt in seq:
if nt not in aa:
nt = 'N'
aa[nt] = aa[nt] + 1
GC = (100.0 * (aa['G'] + aa['C'])) / len(seq)
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', "%s\n\n" %
(time.strftime('%y %b %d, %X\n',
time.localtime(time.time()))) +
"Length = %d\nA=%d C=%d G=%d T=%d other=%d\nGC=%f\n\n" %
(len(seq), aa['A'], aa['C'], aa['G'], aa['T'], aa['N'], GC))