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Python Artifact.extract方法代碼示例

本文整理匯總了Python中qiime.sdk.Artifact.extract方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Artifact.extract方法的具體用法?Python Artifact.extract怎麽用?Python Artifact.extract使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在qiime.sdk.Artifact的用法示例。


在下文中一共展示了Artifact.extract方法的2個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_extract

# 需要導入模塊: from qiime.sdk import Artifact [as 別名]
# 或者: from qiime.sdk.Artifact import extract [as 別名]
    def test_extract(self):
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'artifact.qza')
        artifact = Artifact._from_view([-1, 42, 0, 43], FourInts,
                                       self.provenance)
        artifact.save(fp)

        output_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'artifact-extract-test')
        result_dir = Artifact.extract(fp, output_dir=output_dir)
        self.assertEqual(result_dir, output_dir)

        contents = [
            'artifact/VERSION',
            'artifact/metadata.yaml',
            'artifact/README.md',
            'artifact/data/file1.txt',
            'artifact/data/file2.txt',
            'artifact/data/nested/file3.txt',
            'artifact/data/nested/file4.txt']
        for fp in contents:
            expected_fp = os.path.join(output_dir, fp)
            self.assertTrue(os.path.exists(expected_fp),
                            'File %s was not extracted.' % fp)
開發者ID:Kleptobismol,項目名稱:qiime2,代碼行數:24,代碼來源:test_artifact.py

示例2: test_extract

# 需要導入模塊: from qiime.sdk import Artifact [as 別名]
# 或者: from qiime.sdk.Artifact import extract [as 別名]
    def test_extract(self):
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'artifact.qza')
        artifact = Artifact.import_data(FourInts, [-1, 42, 0, 43])
        artifact.save(fp)

        root_dir = str(artifact.uuid)
        output_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'artifact-extract-test')
        result_dir = Artifact.extract(fp, output_dir=output_dir)
        self.assertEqual(result_dir, os.path.join(output_dir, root_dir))

        expected = {
            'VERSION',
            'metadata.yaml',
            'data/file1.txt',
            'data/file2.txt',
            'data/nested/file3.txt',
            'data/nested/file4.txt',
            'provenance/metadata.yaml',
            'provenance/VERSION',
            'provenance/action/action.yaml'
        }

        self.assertExtractedArchiveMembers(output_dir, root_dir, expected)
開發者ID:qiime2,項目名稱:qiime2,代碼行數:25,代碼來源:test_artifact.py


注:本文中的qiime.sdk.Artifact.extract方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。