當前位置: 首頁>>代碼示例>>Python>>正文


Python Volume.copyInfo方法代碼示例

本文整理匯總了Python中pyworkflow.em.data.Volume.copyInfo方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Volume.copyInfo方法的具體用法?Python Volume.copyInfo怎麽用?Python Volume.copyInfo使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在pyworkflow.em.data.Volume的用法示例。


在下文中一共展示了Volume.copyInfo方法的5個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: createOutputStep

# 需要導入模塊: from pyworkflow.em.data import Volume [as 別名]
# 或者: from pyworkflow.em.data.Volume import copyInfo [as 別名]
 def createOutputStep(self):
     partSet = self.inputParticles.get()
     vol = Volume()
     vol.setFileName(self._getFileName("volume"))
     vol.copyInfo(partSet)
     self._defineOutputs(outputVolume=vol)
     self._defineSourceRelation(self.inputParticles, vol)
開發者ID:I2PC,項目名稱:scipion,代碼行數:9,代碼來源:protocol_reconstruct.py

示例2: createOutputStep

# 需要導入模塊: from pyworkflow.em.data import Volume [as 別名]
# 或者: from pyworkflow.em.data.Volume import copyInfo [as 別名]
 def createOutputStep(self):
     iterN = self.numberOfIterations.get()
     partSet = self._getInputParticles()
     numRun = self._getRun()
     
     vol = Volume()
     vol.setFileName(self._getFileName("volume",run=numRun, iter=iterN))
     vol.copyInfo(partSet)
     
     newPartSet = self._createSetOfParticles()
     newPartSet.copyInfo(partSet)
     self._fillDataFromIter(newPartSet, iterN)
     
     self._defineOutputs(outputVolume=vol)
     self._defineSourceRelation(self._getInputParticlesPointer(), vol)
     self._defineOutputs(outputParticles=newPartSet)
     self._defineTransformRelation(self._getInputParticlesPointer(), newPartSet)
開發者ID:azazellochg,項目名稱:scipion,代碼行數:19,代碼來源:protocol_refineasy.py

示例3: createOutputStep

# 需要導入模塊: from pyworkflow.em.data import Volume [as 別名]
# 或者: from pyworkflow.em.data.Volume import copyInfo [as 別名]
 def createOutputStep(self):
     iterN = self.numberOfIterations.get()
     partSet = self._getInputParticles()
     numRun = self._getRun()
     
     vol = Volume()
     vol.setFileName(self._getFileName("volume",run=numRun, iter=iterN))
     vol.copyInfo(partSet)
     
     self._execEmanProcess(numRun, iterN)
     newPartSet = self._createSetOfParticles()
     newPartSet.copyInfo(partSet)
     newPartSet.setAlignment(em.ALIGN_PROJ)
     newPartSet.copyItems(partSet,
                          updateItemCallback=self._createItemMatrix,
                          itemDataIterator=self._iterTextFile(iterN))
     
     self._defineOutputs(outputVolume=vol)
     self._defineSourceRelation(self._getInputParticlesPointer(), vol)
     self._defineOutputs(outputParticles=newPartSet)
     self._defineTransformRelation(self._getInputParticlesPointer(), newPartSet)
開發者ID:denisfortun,項目名稱:scipion,代碼行數:23,代碼來源:protocol_refineasy.py

示例4: createOutputStep

# 需要導入模塊: from pyworkflow.em.data import Volume [as 別名]
# 或者: from pyworkflow.em.data.Volume import copyInfo [as 別名]
 def createOutputStep(self):
     iterN = self.numberOfIterations.get()
     partSet = self._getInputParticles()
     numRun = self._getRun()
     
     vol = Volume()
     
     
     vol.setFileName(self._getFileName("mapFull",run=numRun, iter=iterN))
     halfMap1 = self._getFileName("mapEvenUnmasked", run=numRun)
     halfMap2 = self._getFileName("mapOddUnmasked", run=numRun)
     vol.setHalfMaps([halfMap1, halfMap2])
     vol.copyInfo(partSet)
     
     newPartSet = self._createSetOfParticles()
     newPartSet.copyInfo(partSet)
     self._fillDataFromIter(newPartSet, iterN)
     
     self._defineOutputs(outputVolume=vol)
     self._defineSourceRelation(self._getInputParticlesPointer(), vol)
     self._defineOutputs(outputParticles=newPartSet)
     self._defineTransformRelation(self._getInputParticlesPointer(), newPartSet)
開發者ID:I2PC,項目名稱:scipion,代碼行數:24,代碼來源:protocol_refineasy.py

示例5: createOutputStep

# 需要導入模塊: from pyworkflow.em.data import Volume [as 別名]
# 或者: from pyworkflow.em.data.Volume import copyInfo [as 別名]
    def createOutputStep(self):
        volSet = self.inputVolumes.get()
        if self._isSingleInput():
            vol = Volume()
            vol.copyInfo(volSet)
            if self.doResize:
                vol.setSamplingRate(self.samplingRate)
            vol.setFileName(self.outputStk)
            self._defineOutputs(outputVol=vol)
        else:
            volumes = self._createSetOfVolumes()
            volumes.copyInfo(volSet)
            if self.doResize:
                volumes.setSamplingRate(self.samplingRate)
            for i, vol in enumerate(volSet):
                j = i + 1
                vol.setSamplingRate(self.samplingRate)
                vol.setLocation(j, self.outputStk)
                volumes.append(vol)
            self._defineOutputs(outputVol=volumes)

        self._defineTransformRelation(volSet, self.outputVol)
開發者ID:josegutab,項目名稱:scipion,代碼行數:24,代碼來源:protocol_crop_resize.py


注:本文中的pyworkflow.em.data.Volume.copyInfo方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。