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Python VaspInput.write_input方法代碼示例

本文整理匯總了Python中pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput.write_input方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python VaspInput.write_input方法的具體用法?Python VaspInput.write_input怎麽用?Python VaspInput.write_input使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput的用法示例。


在下文中一共展示了VaspInput.write_input方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: VaspInputTest

# 需要導入模塊: from pymatgen.io.vaspio.vasp_input import VaspInput [as 別名]
# 或者: from pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput import write_input [as 別名]
class VaspInputTest(unittest.TestCase):

    def setUp(self):
        filepath = os.path.join(test_dir, 'INCAR')
        incar = Incar.from_file(filepath)
        filepath = os.path.join(test_dir, 'POSCAR')
        poscar = Poscar.from_file(filepath)
        if "VASP_PSP_DIR" not in os.environ:
            test_potcar_dir = os.path.abspath(
                os.path.join(os.path.dirname(__file__), "..", "..", "..", "..",
                             "test_files"))
            os.environ["VASP_PSP_DIR"] = test_potcar_dir
        filepath = os.path.join(test_dir, 'POTCAR')
        potcar = Potcar.from_file(filepath)
        filepath = os.path.join(test_dir, 'KPOINTS.auto')
        kpoints = Kpoints.from_file(filepath)
        self.vinput = VaspInput(incar, kpoints, poscar, potcar)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.vinput.as_dict()
        vinput = VaspInput.from_dict(d)
        comp = vinput["POSCAR"].structure.composition
        self.assertEqual(comp, Composition("Fe4P4O16"))

    def test_write(self):
        tmp_dir = "VaspInput.testing"
        self.vinput.write_input(tmp_dir)

        filepath = os.path.join(tmp_dir, "INCAR")
        incar = Incar.from_file(filepath)
        self.assertEqual(incar["NSW"], 99)

        for name in ("INCAR", "POSCAR", "POTCAR", "KPOINTS"):
            os.remove(os.path.join(tmp_dir, name))

        os.rmdir(tmp_dir)

    def test_from_directory(self):
        vi = VaspInput.from_directory(test_dir,
                                      optional_files={"CONTCAR.Li2O": Poscar})
        self.assertEqual(vi["INCAR"]["ALGO"], "Damped")
        self.assertIn("CONTCAR.Li2O", vi)
        d = vi.as_dict()
        vinput = VaspInput.from_dict(d)
        self.assertIn("CONTCAR.Li2O", vinput)
開發者ID:ychaojia,項目名稱:pymatgen,代碼行數:47,代碼來源:test_vasp_input.py


注:本文中的pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput.write_input方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。