本文整理匯總了Python中pygr.seqdb.SequenceFileDB.filepath方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python SequenceFileDB.filepath方法的具體用法?Python SequenceFileDB.filepath怎麽用?Python SequenceFileDB.filepath使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類pygr.seqdb.SequenceFileDB
的用法示例。
在下文中一共展示了SequenceFileDB.filepath方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: test_basic_iadd
# 需要導入模塊: from pygr.seqdb import SequenceFileDB [as 別名]
# 或者: from pygr.seqdb.SequenceFileDB import filepath [as 別名]
def test_basic_iadd(self):
dnaseq = testutil.datafile('dnaseq.fasta')
seqdb = SequenceFileDB(dnaseq)
try:
new_seq = seqdb['seq1']
self.db += new_seq
assert new_seq in self.db
name = (~self.db)[new_seq]
assert name == 'dnaseq.seq1', name
###
seqdb2 = SequenceFileDB(dnaseq)
try:
# Munge the filepath for testing.
seqdb2.filepath = 'foo'
new_seq2 = seqdb2['seq1']
self.db += new_seq2
name2 = (~self.db)[new_seq2]
assert name2 == 'foo.seq1', name2
finally:
seqdb2.close()
finally:
seqdb.close()