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Python GeminiPlugin._get_transcripts方法代碼示例

本文整理匯總了Python中puzzle.plugins.GeminiPlugin._get_transcripts方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python GeminiPlugin._get_transcripts方法的具體用法?Python GeminiPlugin._get_transcripts怎麽用?Python GeminiPlugin._get_transcripts使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在puzzle.plugins.GeminiPlugin的用法示例。


在下文中一共展示了GeminiPlugin._get_transcripts方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_get_transcripts

# 需要導入模塊: from puzzle.plugins import GeminiPlugin [as 別名]
# 或者: from puzzle.plugins.GeminiPlugin import _get_transcripts [as 別名]
def test_get_transcripts(gemini_path):
    adapter = GeminiPlugin(db=gemini_path)
    gemini_variant = {'variant_id': 1}
    transcripts = []
    for transcript in adapter._get_transcripts(gemini_variant):
        transcripts.append(transcript)
    
    assert len(transcripts) == 2
    
    first_transcript = transcripts[0]
    
    assert first_transcript.transcript_id == 'ENST00000370383'
    assert first_transcript.hgnc_symbol == 'EPHX4'
    assert first_transcript.consequence == 'missense_variant'
    assert first_transcript.ensembl_id == None
    assert first_transcript.biotype == 'protein_coding'
    assert first_transcript.sift == 'deleterious'
    assert first_transcript.polyphen == 'probably_damaging'
開發者ID:J35P312,項目名稱:PuzzleWin,代碼行數:20,代碼來源:test_variant_mixin.py


注:本文中的puzzle.plugins.GeminiPlugin._get_transcripts方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。