Python Env.hail方法代碼示例

本文整理匯總了Python中hail.java.Env.hail方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python Env.hail方法的具體用法？Python Env.hail怎麽用？Python Env.hail使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類hail.java.Env的用法示例。

在下文中一共展示了Env.hail方法的10個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: parse

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
    def parse(string):
        """Parses a locus object from a CHR:POS string.

        :rtype: :class:`.Locus`
        """

        return Locus._from_java(scala_object(Env.hail().variant, 'Locus').parse(string))

開發者ID:Fedja，項目名稱:hail，代碼行數:9，代碼來源:variant.py

示例2: init

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def __init__(self, element_type):
     """
     :param :class:`.Type` element_type: Hail type of set element
     """
     jtype = scala_object(Env.hail().expr, 'TSet').apply(element_type._jtype)
     self.element_type = element_type
     super(TSet, self).__init__(jtype)

開發者ID:Fedja，項目名稱:hail，代碼行數:9，代碼來源:expr.py

示例3: init

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def __init__(self, contig, position):
     if isinstance(contig, int):
         contig = str(contig)
     jrep = scala_object(Env.hail().variant, 'Locus').apply(contig, position)
     self._init_from_java(jrep)
     self._contig = contig
     self._position = position

開發者ID:jbloom22，項目名稱:hail，代碼行數:9，代碼來源:variant.py

示例4: _convert_to_j

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def _convert_to_j(self, annotation):
     if annotation is not None:
         return scala_object(Env.hail().annotations, 'Annotation').fromSeq(
             Env.jutils().arrayListToISeq(
                 [f.typ._convert_to_j(annotation.get(f.name)) for f in self.fields]
             )
         )
     else:
         return annotation

開發者ID:Fedja，項目名稱:hail，代碼行數:11，代碼來源:expr.py

示例5: parse

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
    def parse(cls, string):
        """Parses a locus object from a CHR:POS string.

        **Examples**

        >>> l1 = Locus.parse('1:101230')
        >>> l2 = Locus.parse('X:4201230')

        :rtype: :class:`.Locus`
        """

        return Locus._from_java(scala_object(Env.hail().variant, 'Locus').parse(string))

開發者ID:jbloom22，項目名稱:hail，代碼行數:14，代碼來源:variant.py

示例6: _jrep

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def _jrep(self):
     return Env.hail().stats.BetaDist.apply(float(self.a), float(self.b))

開發者ID:jbloom22，項目名稱:hail，代碼行數:4，代碼來源:stats.py

示例7: _to_java

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def _to_java(self):
     """Convert to Java TextTableConfiguration object."""
     return Env.hail().utils.TextTableConfiguration.apply(self.types, self.comment,
                                                        self.delimiter, self.missing,
                                                        self.noheader, self.impute)

開發者ID:Fedja，項目名稱:hail，代碼行數:7，代碼來源:utils.py

示例8: init

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def __init__(self):
     jtype = scala_object(Env.hail().expr, 'TInterval').apply(Env.hail().variant.GenomeReference.GRCh37())
     super(TInterval, self).__init__(jtype)

開發者ID:jbloom22，項目名稱:hail，代碼行數:5，代碼來源:expr.py

示例9: types_rst

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def types_rst(self, file_name):
     Env.hail().utils.FunctionDocumentation.makeTypesDocs(file_name)

開發者ID:jbloom22，項目名稱:hail，代碼行數:4，代碼來源:utils.py

示例10: functions_rst

# 需要導入模塊: from hail.java import Env [as 別名]
# 或者: from hail.java.Env import hail [as 別名]
 def functions_rst(self, file_name):
     Env.hail().utils.FunctionDocumentation.makeFunctionsDocs(file_name)