Python Bed.mask_cds方法代碼示例

本文整理匯總了Python中flatfeature.Bed.mask_cds方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python Bed.mask_cds方法的具體用法？Python Bed.mask_cds怎麽用？Python Bed.mask_cds使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類flatfeature.Bed的用法示例。

在下文中一共展示了Bed.mask_cds方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: Bed

# 需要導入模塊: from flatfeature import Bed [as 別名]
# 或者: from flatfeature.Bed import mask_cds [as 別名]
# write a genomic fasta file with all sequences covered by features
# in the specified Bed file masked to N.
from flatfeature import Bed
import sys
# b = Bed(sys.argv[1], sys.argv[2])
b = Bed("/Users/gturco/data/rice_v6.bed", "/Users/gturco/data/rice_v6.fasta")

for seqid, seq in b.mask_cds():
    seqids =  []
    seq.tostring()

開發者ID:jschnable，項目名稱:find_cns，代碼行數:12，代碼來源:write_masked_genomic_fasta.py

注：本文中的flatfeature.Bed.mask_cds方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台，相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目，源碼版權歸原作者所有，傳播和使用請參考對應項目的License；未經允許，請勿轉載。