本文整理匯總了Python中cogent.struct.rna2d.Pairs.toPartners方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Pairs.toPartners方法的具體用法?Python Pairs.toPartners怎麽用?Python Pairs.toPartners使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類cogent.struct.rna2d.Pairs
的用法示例。
在下文中一共展示了Pairs.toPartners方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: test_toPartners
# 需要導入模塊: from cogent.struct.rna2d import Pairs [as 別名]
# 或者: from cogent.struct.rna2d.Pairs import toPartners [as 別名]
def test_toPartners(self):
"""Pairs toPartners() should return a Partners object"""
a = Pairs([(1,5),(3,4),(6,9),(7,8)]) #normal
b = Pairs([(0,4),(2,6)]) #pseudoknot
c = Pairs([(1,6),(3,6),(4,5)]) #conflict
self.assertEqual(a.toPartners(10),[None,5,None,4,3,1,9,8,7,6])
self.assertEqual(a.toPartners(13,3),\
[None,None,None,None,8,None,7,6,4,12,11,10,9])
assert isinstance(a.toPartners(10),Partners)
self.assertEqual(b.toPartners(7),[4,None,6,None,0,None,2])
self.assertRaises(ValueError,c.toPartners,7)
self.assertEqual(c.toPartners(7,strict=False),[None,None,None,6,5,4,3])
#raises an error when try to insert something at non-existing indices
self.assertRaises(IndexError,c.toPartners,0)