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Python Profile.distance方法代碼示例

本文整理匯總了Python中cogent.core.profile.Profile.distance方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Profile.distance方法的具體用法?Python Profile.distance怎麽用?Python Profile.distance使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在cogent.core.profile.Profile的用法示例。


在下文中一共展示了Profile.distance方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_distance

# 需要導入模塊: from cogent.core.profile import Profile [as 別名]
# 或者: from cogent.core.profile.Profile import distance [as 別名]
    def test_distance(self):
        """distance: should return correct distance between the profiles
        """
        p1 = Profile(array([[2, 4], [3, 1]]), "AB")
        p2 = Profile(array([[4, 6], [5, 3]]), "AB")
        p3 = Profile(array([[4, 6], [5, 3], [1, 1]]), "AB")
        p4 = Profile(array([2, 2]), "AB")
        p5 = Profile(array([2, 2, 2]), "AB")
        p6 = Profile(array([[]]), "AB")

        self.assertEqual(p1.distance(p2), 4)
        self.assertEqual(p2.distance(p1), 4)
        self.assertEqual(p1.distance(p4), sqrt(6))
        self.assertEqual(p6.distance(p6), 0)

        # Raises error when frames are not aligned
        self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p3)
        self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p5)
開發者ID:blankenberg,項目名稱:pycogent,代碼行數:20,代碼來源:test_profile.py


注:本文中的cogent.core.profile.Profile.distance方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。