本文整理匯總了Python中cogent.core.profile.Profile.distance方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Profile.distance方法的具體用法?Python Profile.distance怎麽用?Python Profile.distance使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類cogent.core.profile.Profile
的用法示例。
在下文中一共展示了Profile.distance方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: test_distance
# 需要導入模塊: from cogent.core.profile import Profile [as 別名]
# 或者: from cogent.core.profile.Profile import distance [as 別名]
def test_distance(self):
"""distance: should return correct distance between the profiles
"""
p1 = Profile(array([[2, 4], [3, 1]]), "AB")
p2 = Profile(array([[4, 6], [5, 3]]), "AB")
p3 = Profile(array([[4, 6], [5, 3], [1, 1]]), "AB")
p4 = Profile(array([2, 2]), "AB")
p5 = Profile(array([2, 2, 2]), "AB")
p6 = Profile(array([[]]), "AB")
self.assertEqual(p1.distance(p2), 4)
self.assertEqual(p2.distance(p1), 4)
self.assertEqual(p1.distance(p4), sqrt(6))
self.assertEqual(p6.distance(p6), 0)
# Raises error when frames are not aligned
self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p3)
self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p5)