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Python Strand.connection3p方法代碼示例

本文整理匯總了Python中cadnano.strand.Strand.connection3p方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python Strand.connection3p方法的具體用法?Python Strand.connection3p怎麽用?Python Strand.connection3p使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在cadnano.strand.Strand的用法示例。


在下文中一共展示了Strand.connection3p方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: __init__

# 需要導入模塊: from cadnano.strand import Strand [as 別名]
# 或者: from cadnano.strand.Strand import connection3p [as 別名]
    def __init__(self, strandset: StrandSetT, strand: Strand, solo: bool = True):
        super(RemoveStrandCommand, self).__init__("remove strands")
        self._strandset = strandset
        self._strand = strand
        self._solo = solo
        self._old_strand5p = strand.connection5p()
        self._old_strand3p = strand.connection3p()
        self._oligo = olg = strand.oligo()

        part = strand.part()
        # idxs = strand.idxs()
        self.mids = (part.getModID(strand, strand.lowIdx()),
                     part.getModID(strand, strand.highIdx()))

        # only create a new 5p oligo if there is a 3' connection
        self._new_oligo5p = olg.shallowCopy() if self._old_strand5p else None
        if olg.isCircular() or self._old_strand3p is None:
            self._new_oligo3p = olg3p = None
            if self._new_oligo5p:
                self._new_oligo5p._setLoop(False)
        else:
            self._new_oligo3p = olg3p = olg.shallowCopy()
            olg3p.setStrand5p(self._old_strand3p)
            # color_list = styles.STAP_COLORS if strandset.isStaple() else prefs.SCAF_COLORS
            color_list = pathstyles.STAP_COLORS
            color = random.choice(color_list)
            olg3p._setColor(color)
            olg3p.refreshLength(emit_signals=True)
開發者ID:cadnano,項目名稱:cadnano2.5,代碼行數:30,代碼來源:removestrandcmd.py


注:本文中的cadnano.strand.Strand.connection3p方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。