本文整理匯總了Python中atom.Atom.unity方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python Atom.unity方法的具體用法？Python Atom.unity怎麽用？Python Atom.unity使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類atom.Atom的用法示例。
在下文中一共展示了Atom.unity方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: make_residue
# 需要導入模塊: from atom import Atom [as 別名]
# 或者: from atom.Atom import unity [as 別名]
def make_residue(key,hydrogens = True):
""" returns a molecule object with
default geometry"""
if not library._aacids.has_key(key):
raise KeyError, "Residue %s not known" % key
m = Molecule()
m.unity = 'A'
m.resname = key
for i, entry in enumerate(library._aacids[key]):
if hydrogens == False and entry[0][0] == 'H':
continue
else:
a = Atom()
a.id = i+1
a.name = entry[0]
a.symbol = a.name[0]
a.x = entry[1]
a.occ = 1.
a.resname = key
a.m = library._atommass[a.symbol]
a.unity = 'A'
m.atoms.append(a)
return m