本文整理匯總了Python中ParmedTools.ParmedActions.addcoarsegrain方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python ParmedActions.addcoarsegrain方法的具體用法？Python ParmedActions.addcoarsegrain怎麽用？Python ParmedActions.addcoarsegrain使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類ParmedTools.ParmedActions的用法示例。
在下文中一共展示了ParmedActions.addcoarsegrain方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: addcoarsegrain
# 需要導入模塊: from ParmedTools import ParmedActions [as 別名]
# 或者: from ParmedTools.ParmedActions import addcoarsegrain [as 別名]
def addcoarsegrain(root, amber_prmtop, messages):
""" Adds coarse graining to topology file via Lula's algo """
# This implementation doesn't exist anywhere yet, so disable it
showerror('Warning', 'This functionality is not implemented in Amber yet!')
return
# We need a file
fname = file_chooser('Coarse Grain Parameter',
[('Coarse Grain Parameters', '*.cgparm'),
('All Files', '*')])
if not fname: return
try:
action = ParmedActions.addcoarsegrain(amber_prmtop, ArgumentList(fname))
messages.write('%s\n' % action)
action.execute()
except Exception, err:
showerror('Unexpected Error!', '%s: %s' % (type(err).__name__, err))
return