Python PipelineMappingQC.buildPicardGCStats方法代碼示例

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在下文中一共展示了PipelineMappingQC.buildPicardGCStats方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: buildPicardGCStats

# 需要導入模塊: from CGATPipelines import PipelineMappingQC [as 別名]
# 或者: from CGATPipelines.PipelineMappingQC import buildPicardGCStats [as 別名]
def buildPicardGCStats(infile, outfile):
    '''Gather BAM file GC bias stats using Picard '''
    PipelineMappingQC.buildPicardGCStats(infile, outfile,
                                         os.path.join(PARAMS["bwa_index_dir"],
                                                      PARAMS["genome"] + ".fa"))

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