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Python MafIndex._region2bin方法代碼示例

本文整理匯總了Python中Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex._region2bin方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python MafIndex._region2bin方法的具體用法?Python MafIndex._region2bin怎麽用?Python MafIndex._region2bin使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex的用法示例。


在下文中一共展示了MafIndex._region2bin方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_region2bin

# 需要導入模塊: from Bio.AlignIO.MafIO import MafIndex [as 別名]
# 或者: from Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex import _region2bin [as 別名]
    def test_region2bin(self):
        data = [(25079603, 25079787, set([0, 1, 11, 96, 776])),
                (25128173, 25128248, set([0, 1, 11, 96, 776])),
                (50312474, 50312703, set([0, 1, 968, 14, 120])),
                (41905591, 41906101, set([0, 1, 904, 13, 112])),
                (16670899, 16673060, set([0, 1, 10, 712, 88])),
                (75495356, 75495494, set([0, 1, 2, 1160, 144, 17])),
                (92259501, 92261053, set([0, 1, 2, 1288, 160, 19])),
                (83834063, 83838132, set([0, 1, 2, 1224, 18, 152])),
                (7309597, 7310411, set([0, 1, 640, 79, 9])),
                (6190410, 6190999, set([0, 1, 632, 78, 9]))]

        for x, y, z in data:
            self.assertEqual(MafIndex._region2bin(x, y), z)

        for x, y, z in data:
            self.assertRaises(TypeError, MafIndex._region2bin, str(x), str(y))
開發者ID:BioGeek,項目名稱:biopython,代碼行數:19,代碼來源:test_MafIO_index.py


注:本文中的Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex._region2bin方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。