本文整理匯總了Python中System.create_system方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python System.create_system方法的具體用法？Python System.create_system怎麽用？Python System.create_system使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類System的用法示例。
在下文中一共展示了System.create_system方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: run
# 需要導入模塊: import System [as 別名]
# 或者: from System import create_system [as 別名]
polymers.append(poly)
except Exception, e:
logger.exception(e)
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
if np.any(params.box_grid_shape==0):
logger.warning("\n> no box size information provided, skipping system generation...")
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
return
if params.mode=="gromacs":
logger.info("\n> generating system...\n")
system=System(polymers,ff,params)
system.create_system(mypath=folder)
logger.info("\n> All done! Thank you for using Assemble! <")
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
if __name__=="__main__":
#get database filename
#infile="input_tmp"
infile=str(sys.argv[2])
run(infile)