本文整理匯總了Python中PyDSTool.prepJacobian方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python PyDSTool.prepJacobian方法的具體用法？Python PyDSTool.prepJacobian怎麽用？Python PyDSTool.prepJacobian使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類PyDSTool的用法示例。
在下文中一共展示了PyDSTool.prepJacobian方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: plot
# 需要導入模塊: import PyDSTool [as 別名]
# 或者: from PyDSTool import prepJacobian [as 別名]
# plot vector field
pp.plot_PP_vf(dmModel, 's1', 's2', scale_exp=-1.5)
# find dixed points of the model
fp_coord = pp.find_fixedpoints(dmModel, n=4, eps=1e-8)
# plot the null-clines
nulls_x, nulls_y = pp.find_nullclines(dmModel, 's1', 's2', n=3, \
eps=1e-8, max_step=0.01, fps=fp_coord)
plot(nulls_x[:,0], nulls_x[:,1], 'b')
plot(nulls_y[:,0], nulls_y[:,1], 'g')
# compute the jacobian matrix
jac, new_fnspecs = dst.prepJacobian(dmModel.funcspec._initargs['varspecs'],
['s1','s2'],dmModel.funcspec._initargs['fnspecs'])
scope = dst.copy(dmModel.pars)
scope.update(new_fnspecs)
jac_fn = dst.expr2fun(jac, ensure_args=['t'],**scope)
# add fixed points to the phase portrait
for i in range(0,len(fp_coord)):
fp = pp.fixedpoint_2D(dmModel, dst.Point(fp_coord[i]),
jac = jac_fn, eps=1e-8)
pp.plot_PP_fps(fp)
# compute and plot projectories
traj = dmModel.compute('trajectory1')
pts = traj.sample()
plot(pts['s1'], pts['s2'], 'r-o')