本文整理匯總了Python中FileIO.read_fasta方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python FileIO.read_fasta方法的具體用法？Python FileIO.read_fasta怎麽用？Python FileIO.read_fasta使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類FileIO的用法示例。
在下文中一共展示了FileIO.read_fasta方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: load_fasta_background
# 需要導入模塊: import FileIO [as 別名]
# 或者: from FileIO import read_fasta [as 別名]
def load_fasta_background(filename, center='.'):
fasta_list = FileIO.read_fasta(filename);
result = fasta_to_chunks(fasta_list);
if(center != '.'):
result = filter_chunks(result, center);
result = result[0:300000]; #Concatenate because I don't have enough ram
formA = DataManipulation.list_to_formA(result);
return dict([('seq',result),
('formA',formA)]);