當前位置: 首頁>>代碼示例>>Python>>正文


Python tables.Int64Col方法代碼示例

本文整理匯總了Python中tables.Int64Col方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python tables.Int64Col方法的具體用法?Python tables.Int64Col怎麽用?Python tables.Int64Col使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在tables的用法示例。


在下文中一共展示了tables.Int64Col方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: write_snp_tab_h5

# 需要導入模塊: import tables [as 別名]
# 或者: from tables import Int64Col [as 別名]
def write_snp_tab_h5(self):
        snp_tab_h5 = tables.open_file(self.snp_tab_filename, "w")

        class SNPTab(tables.IsDescription):
            name = tables.StringCol(16)
            pos = tables.Int64Col()
            allele1 = tables.StringCol(100)
            allele2 = tables.StringCol(100)

        chrom_tables = {}
        snp_num = 0
        for snp in self.snp_list:
            if snp[0] in chrom_tables:
                table = chrom_tables[snp[0]]
            else:
                table = snp_tab_h5.create_table(snp_tab_h5.root, snp[0], SNPTab)
                chrom_tables[snp[0]] = table

            row = table.row
            snp_num += 1
            row['name'] = "snp%d" % snp_num
            row['pos'] = snp[1]
            row['allele1'] = snp[2]
            row['allele2'] = snp[3]
            row.append()
            table.flush()

        self.write_hap_samples(snp_tab_h5)
        
        snp_tab_h5.close() 
開發者ID:bmvdgeijn,項目名稱:WASP,代碼行數:32,代碼來源:test_find_intersecting_snps.py


注:本文中的tables.Int64Col方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。