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Python Poscar.write_file方法代码示例

本文整理汇总了Python中pymatgen.io.vasp.Poscar.write_file方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Poscar.write_file方法的具体用法?Python Poscar.write_file怎么用?Python Poscar.write_file使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pymatgen.io.vasp.Poscar的用法示例。


在下文中一共展示了Poscar.write_file方法的5个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: mp_id

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp import Poscar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.Poscar import write_file [as 别名]
def mp_id(mpid):
    """
    materials project の ID から POSCAR を作成
    """
    mpr = MPRester("WTxsDhRV7g2Mcbqw")
    strctr = mpr.get_structure_by_material_id(mpid)
    poscar = Poscar(strctr)
    poscar.write_file('POSCAR_{0}'.format(mpid))
开发者ID:hackberie,项目名称:00_workSpace,代码行数:10,代码来源:vasp_poscar.py

示例2: std

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp import Poscar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.Poscar import write_file [as 别名]
def std(src='POSCAR'):
    """
    conventional standard cell に変換
    """
    srcpos = Poscar.from_file(src)
    finder = SpacegroupAnalyzer(srcpos.structure)
    std_str = finder.get_conventional_standard_structure()
    dstpos = Poscar(std_str)
    dst = 'POSCAR_std'
    Cabinet.reserve_file(dst)
    dstpos.write_file(dst)
开发者ID:hackberie,项目名称:00_workSpace,代码行数:13,代码来源:vasp_poscar.py

示例3: prim

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp import Poscar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.Poscar import write_file [as 别名]
def prim(src):
    """
    primitive cell に変換
    """
    srcpos = Poscar.from_file(src)
    finder = SpacegroupAnalyzer(srcpos.structure)
    prim_str = finder.get_primitive_standard_structure()
    dstpos = Poscar(prim_str)
    dst = 'POSCAR_prim'
    Cabinet.reserve_file(dst)
    dstpos.write_file(dst)
开发者ID:hackberie,项目名称:00_workSpace,代码行数:13,代码来源:vasp_poscar.py

示例4: refined

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp import Poscar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.Poscar import write_file [as 别名]
def refined(src):
    """
    refined poscar を 作成する
    """
    srcpos = Poscar.from_file(src)
    finder = SpacegroupAnalyzer(srcpos.structure, symprec=5e-1, angle_tolerance=8)
    scr_std = finder.get_refined_structure()
    dstpos = Poscar(scr_std)
    dst = "POSCAR_refined"
    Cabinet.reserve_file(dst)
    dstpos.write_file(dst)
开发者ID:hackberie,项目名称:00_workSpace,代码行数:13,代码来源:scr_poscar.py

示例5: refined

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp import Poscar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.Poscar import write_file [as 别名]
def refined(src='POSCAR'):
    """
    refined cell を 作成する
    """
    srcpos = Poscar.from_file(src)
    finder = SpacegroupAnalyzer(srcpos.structure,
                                symprec=5e-1, angle_tolerance=8)
    std_str = finder.get_refined_structure()
    dstpos = Poscar(std_str)
    dst = 'POSCAR_refined'
    Cabinet.reserve_file(dst)
    dstpos.write_file(dst)
开发者ID:hackberie,项目名称:00_workSpace,代码行数:14,代码来源:vasp_poscar.py


注:本文中的pymatgen.io.vasp.Poscar.write_file方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。