本文整理汇总了Python中MolKit.molecule.AtomSet.possibleTors方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python AtomSet.possibleTors方法的具体用法？Python AtomSet.possibleTors怎么用？Python AtomSet.possibleTors使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类MolKit.molecule.AtomSet的用法示例。
在下文中一共展示了AtomSet.possibleTors方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: range
# 需要导入模块: from MolKit.molecule import AtomSet [as 别名]
# 或者: from MolKit.molecule.AtomSet import possibleTors [as 别名]
allAts = mol.allAtoms
for b in allAts.bonds[0]:
if b.activeTors: b.activeTors = 0
torscount = 0
tM = mol.torTree.torsionMap
for i in range(len(tM)):
bnum0, bnum1 = tM[i].bond
a0 = allAts.get(lambda x: x.number==bnum0 + 1)[0]
a0.tt_ind = bnum0
a1 = allAts.get(lambda x: x.number==bnum1 + 1)[0]
a1.tt_ind = bnum1
b = AtomSet([a0,a1]).bonds[0]
if hasattr(b, 'possibleTors'):
assert b.possibleTors
else:
b.possibleTors = 1
b.activeTors = 1
torscount = torscount + 1
mol.torscount = torscount
mol.ROOT = mol.allAtoms[0]
mol.ROOT.rnum0 = 0
mol.LPO.write(outputfilename)
# To execute this command type:
# repair_ligand4.py -f pdbqt_filename [-o outputfilename] -v