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Java BasicFastqWriter类代码示例

本文整理汇总了Java中htsjdk.samtools.fastq.BasicFastqWriter的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java BasicFastqWriter类的具体用法?Java BasicFastqWriter怎么用?Java BasicFastqWriter使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的类代码示例或许可以为您提供帮助。


BasicFastqWriter类属于htsjdk.samtools.fastq包,在下文中一共展示了BasicFastqWriter类的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: openFastqWriter

import htsjdk.samtools.fastq.BasicFastqWriter; //导入依赖的package包/类
/** Open a new FASTQ writer from a Path. */
public FastqWriter openFastqWriter(final Path path) {
    checkOutputAndCreateDirs(path);
    final PrintStream writer = new PrintStream(getOutputStream(path));
    final FastqWriter fastqWriter = new BasicFastqWriter(writer);
    return (this.useAsyncIo)
            ? new AsyncFastqWriter(fastqWriter, asyncOutputBufferSize)
            : fastqWriter;
}
 
开发者ID:magicDGS,项目名称:ReadTools,代码行数:10,代码来源:ReadWriterFactory.java

示例2: setOutputStream

import htsjdk.samtools.fastq.BasicFastqWriter; //导入依赖的package包/类
@Override
public void setOutputStream(final OutputStream os) {
    writer = new BasicFastqWriter(new PrintStream(os));
}
 
开发者ID:broadinstitute,项目名称:picard,代码行数:5,代码来源:IlluminaBasecallsToFastq.java


注:本文中的htsjdk.samtools.fastq.BasicFastqWriter类示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。